| 船名（欧文表記） | 船名（日本語） | 船種 | 総トン数／重量トン数 | 建造年 | 運航または船主、所属等 |
| Ecstasy | エクスタシー | 客船 | 70,367GT／ | 1991年 | CCL |
| Eden Bridge | エデン・ブリッジ | 鉱石兼撒積兼油槽船 | 79,317GT／145,053DWT | 1972年 | H. クラークソン |
| Edinburgh Castle | エディンバラ・キャッスル | 客船（貨客船） | 28,705GT／ | 1948年 | ユニオン・キャッスル・ライン |
| Egypt | エジプト | 客船 | 7,912GT／ | 1897年 | P&Oライン |
| Ehime Maru | 愛媛丸 | セメント運搬船 | 1,403GT／2,485DWT | 1979年 | 伊豫海運 |
| Ehime Maru | えひめ丸 | 水産実習船 | 499GT／ | 2002年 | 愛媛県立宇和島水産高校 |
| Ehime No.5 | 第五愛媛 | カーフェリー | 253GT／ | 1990年 | 芸予観光フェリー |
| Eiho Maru | 英鳳丸 | 曳船（タグボート） | 175GT／ | 1968年 | 日東運輸、川汽不動産 |
| Eins Soya | アインス宗谷 | カーフェリー | 2,267GT／503DWT | 1997年 | 東日本海フェリー |
| Eishun | 榮春 | 自動車運搬船 | 33,854GT／8,531DWT | 1999年 | リベロ・パナマ |
| Eitoku Maru | 英徳丸 | 冷蔵運搬船 | 3,489GT／5,787DWT | 1977年 | 徳丸海運 |
| El Greco | エル・グレコ | カーフェリー | 9,562GT／ | 1972年 | ミノアン・ライン |
| El Venizelos | エル・ヴェニゼロス | カーフェリー | 38,261GT／ | 1992年 | ANEK（アネク）・ライン |
| Elation | イレーション | 客船 | 70,390GT／ | 1998年 | CCL |
| Elbe Express | エルベ・エクスプレス | コンテナ船 | 14,069GT／10,800DWT | 1968年 | ハパク・ロイド |
| Elbe Maru | えるべ丸 | コンテナ船 | 51,623GT／35,229DWT | 1972年 | 大阪商船三井船舶 |
| Elbe Maru | えるべ丸 | 鉱石兼油槽船 | 87,534GT／158,593DWT | 1975年 | 三光汽船 |
| El-Djazair | エル・ジャザイール | カーフェリー | 12,124GT／ | 1971年 | アルジェリア船舶公団 |
| Eleonora Maersk | エレオノーラ・マースク | コンテナ船 | 170,794GT／156,907DWT | 2006年 | マースク・ライン |
| Elia | エリア | タンカー | 61,991GT／115,338DWT | 2006年 | ニコルソン |
| Emerald Princess | エメラルド・プリンセス | 客船 | 112,894GT／ | 2007年 | プリンセス・クルーズ |
| Emma Maersk | エマ・マースク | コンテナ船 | 170,794GT／156,907DWT | 2006年 | マースク・ライン |
| Empress of Asia | エンプレス・オブ・エイシア | 客船 | 16,909GT／ | 1913年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Britain | エンプレス・オブ・ブリテン | 客船 | 42,348GT／ | 1931年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Canada | エンプレス・オブ・カナダ | 客船 | 21,517GT／ | 1922年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Canada | エンプレス・オブ・カナダ | 客船 | 20,022GT／ | 1928年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of China | エンプレス・オブ・チャイナ | 客船 | 5,905GT／ | 1891年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Ireland | エンプレス・オブ・アイルランド | 客船 | 14,191GT／ | 1906年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Japan | エンプレス・オブ・ジャパン | 客船 | 5,940GT／ | 1891年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Japan | エンプレス・オブ・ジャパン | 客船 | 26,032GT／ | 1930年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Russia | エンプレス・オブ・ラシア | 客船 | 16,810GT／9,135DWT | 1913年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Scotland | エンプレス・オブ・スコットランド | 客船 | 25,037GT／ | 1906年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of Scotland | エンプレス・オブ・スコットランド | 客船 | 26,032GT／ | 1930年 | CPL（カナディアン・パシフィック・ライン） |
| Empress of the Seas | エンプレス・オブ・ザ・シーズ | 客船 | 48,563GT／ | 1990年 | RCI |
| Enchantment of the Seas | エンチャントメント・オブ・ザ・シーズ | 客船 | 82,910GT／ | 1997年 | RCI |
| Energy Transmission | エナジー・トランスミッション | 鉱石兼油槽船 | 79,493GT／158,646DWT | 1973年 | ユナイテッド・バルク・キャリアーズ＆タンカーズ |
| Energy Transport | エナジー・トランスポート | タンカー | 99,332GT／217,154DWT | 1969年 | オリエンタル・ペトロリウム・キャリアーズ |
| England | イングランド | カーフェリー | 8,117GT／ | 1964年 | DFDS |
| Enoshima Maru | 江の島丸 | 漁業調査指導船 | 105GT／ | 2005年 | 神奈川県 |
| Erasmus 2 | エラスムス2 | 高速旅客船 | 19GT／7DWT | 1997年 | 安田産業汽船 |
| Eridge | エリッジ | 鉱石兼撒積兼油槽船 | 42,825GT／73,859DWT | 1966年 | ザ・ペニンシュラ＆オリエンタル・スチーム・ナヴィゲーション |
| Erie Maru | 江りい丸 | 貨物船 | 5,467GT／8,752DWT | 1920年 | 国際汽船 |
| Erimo Maru | えりも丸 | カーフェリー | 7,858GT／3,172DWT | 1972年 | 日本沿海フェリー |
| Erimo Maru | えりも丸 | コンテナ船（内航） | 3,331GT／3,014DWT | 1984年 | 日本通運 |
| Esan | えさん | 貨物フェリー | 1,998GT／1,459DWT | 1988年 | 道南自動車フェリー |
| Esan 2000 | えさん2000 | カーフェリー | 2,367GT／1,853DWT | 2000年 | 道南自動車フェリー |
| Espoir | エスポアール | 遊覧船 | 401GT／ | 1993年 | 洞爺湖汽船 |
| Esso Atlantic | エッソ・アトランティック | タンカー | 234,627GT／516,895DWT | 1977年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Deutschland | エッソ・ドイッチュラント | タンカー | 203,869GT／421,681DWT | 1976年 | エッソ・アクティエンゲゼルシャフト |
| Esso Honolulu | エッソ・ホノルル | タンカー | 132,999GT／283,398DWT | 1974年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Japan | エッソ・ジャパン | タンカー | 192,679GT／406,641DWT | 1976年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Kagoshima | エッソ・カゴシマ | タンカー | 114,797GT／261,159DWT | 1973年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Kawasaki | エッソ・カワサキ | タンカー | 138,114GT／307,432DWT | 1974年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Northumbria | エッソ・ノーサンブリア | タンカー | 126,543GT／254,277DWT | 1970年 | エッソ・ペトローリアム |
| Esso Osaka | エッソ・オオサカ | タンカー | 133,002GT／283,155DWT | 1973年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Pacific | エッソ・パシフィック | タンカー | 234,627GT／516,424DWT | 1977年 | エッソ・タンカーズ |
| Esso Tokyo | エッソ・トーキョー | タンカー | 192,673GT／406,259DWT | 1976年 | エッソ・タンカーズ |
| Estelle Maersk | エステル・マースク | コンテナ船 | 170,794GT／156,907DWT | 2006年 | マースク・ライン |
| Estonia | エストニア | カーフェリー | 15,566GT／ | 1980年 | エストライン |
| Etajima No.8 | えたじま八号 | 旅客船 | 19GT／ | 1994年 | 江能汽船 |
| Eternal Light | エターナル・ライト | 鉱石兼油槽船 | 45,501GT／78,014DWT | 1973年 | 三光汽船 |
| Etomo Maru | 絵鞆丸 | 石灰石運搬船 | 2,442GT／3,581DWT | 1968年 | 日和産業海運 |
| Eurodam | ユーロダム | 客船 | 86,273GT／ | 2008年 | HAL（ホランド・アメリカ・ライン） |
| Euroferrys Pacifica | ユーロフェリーズ・パシフィカ | カーフェリー | 8,397GT／750DWT | 2001年 | ユーロフェリーズ |
| Euroliner | ユーロライナー | コンテナ船 | 31,038GT／27,984DWT | 1971年 | シートレイン・ライン |
| Europa | オイローパ | 客船 | 49,746GT／ | 1930年 | 北ドイツ・ロイド（NDL） |
| Europa | オイローパ | 客船 | 37,301GT／ | 1981年 | ハパク・ロイド・クルーズ |
| Europa | オイローパ | 客船 | 28,890GT／ | 1999年 | ハパク・ロイド・クルーズ |
| Europian Stars | ヨーロピアン・スターズ | 客船 | 58,625GT／ | 2002年 | フェスティバル・クルーズ |
| Europian Vision | ヨーロピアン・ヴィジョン | 客船 | 58,714GT／ | 2001年 | フェスティバル・クルーズ |
| Ever Champion | エヴァー・チャンピオン | コンテナ船 | 90,465GT／100,864DWT | 2005年 | エヴァーグリーン |
| Ever Dainty | エヴァー・デインティ | コンテナ船 | 52,090GT／55,600DWT | 1997年 | エヴァーグリーン |
| Ever Decent | エヴァー・ディーセント | コンテナ船 | 52,090GT／55,604DWT | 1997年 | エヴァーグリーン |
| Ever Renown | エヴァー・リナウン | コンテナ船 | 53,103GT／ | 1994年 | エヴァーグリーン |
| Ever Royal | エヴァー・ロイアル | コンテナ船 | 53,359GT／57,904DWT | 1993年 | エヴァーグリーン |
| Ever Spring | エヴァー・スプリング | コンテナ船 | 10,166GT／14,892DWT | 1975年 | エヴァーグリーン |
| Ever Unity | エヴァー・ユニティ | コンテナ船 | 69,246GT／ | 1999年 | エヴァーグリーン |
| Ever Victory | エヴァー・ヴィクトリー | コンテナ船 | 14,815GT／20,194DWT | 1978年 | エヴァーグリーン |
| Excellent | エクセレント | カーフェリー | 39,739GT／ | 1998年 | グリマルディ・ライン |
| Explorer | エクスプローラー | 客船 | 2,398GT／ | 1969年 | ギャップ・アドヴェンチャー |
| Explorer | エクスプローラー | 客船（洋上大学船） | 24,391GT／ | 2002年 | ヴァージニア大学 |
| Explorer of the Seas | エクスプローラー・オブ・ザ・シーズ | 客船 | 137,308GT／ | 2000年 | RCI |
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